Schutz und Er­hal­tung der na­tur­na­hen Laub­wäl­der sowie des na­tür­li­chen Ver­lau­fes der Selke und ihrer Zu­flüs­se; Schutz der Le­bens­räu­me zahl­rei­cher ge­fähr­de­ter Tier- und Pflan­zen­ar­ten. 

Das NSG (200-380 m ü. NN) liegt im LSG "Harz und Vor­län­der" ca. 4 km süd­lich von Bal­len­stedt. Es er­fasst das Tal der Selke von Meis­dorf bis in den Grenz­be­reich zum Land­kreis Qued­lin­burg.

 Das Sel­ke­tal ist reich an na­tur­na­hen Laub­wäl­dern:

• Bo­den­saurer Wachtelweizen-​Traubeneichen-Buchenwald (Lu­zu­lo luzuloides-​Fagetum) an den Schatt­hän­gen, der an Ober­hang­kan­ten tro­cke­ne Aus­bil­dun­gen mit Ech­tem Schaf­schwin­gel (Fes­tu­ca ovina) zeigt,
• Bergahorn-​Buchenwald in fri­schen und nähr­stoff­rei­chen Kol­lu­vi­al­mul­den,
• Ahorn-​Eschen-Schluchtwald (Fraxino-​Aceretum pseu­do­pla­ta­ni) mit Aus­dau­ern­dem Sil­ber­blatt (Lu­na­ria re­di­vi­va) auf schat­ti­gen Steil­hän­gen und Run­sen,
• Erlen-​Eschenwälder im Tal­grund.

Im Tal­grund über­wiegt je­doch das Grün­land.
Zum Teil kom­men noch Schlangenknöterich-​Kohldistelwiesen (An­ge­li­co sylvestris-​Cirsietum ole­racei) vor. Auf nicht mehr ge­nutz­ten Flä­chen sie­deln zu­neh­mend ver­bu­schen­de Landreitgras-​Fluren. Feuch­te Stau­den­flu­ren, Riede, Röh­rich­te und Wei­den­ge­bü­sche säu­men das Ufer.
Die Süd­hän­ge tra­gen xe­ro­ther­me Ve­ge­ta­ti­ons­kom­ple­xe aus

• Fels­flu­ren,
• Fels­spal­ten­ge­sell­schaf­ten,
• Tro­cken­ra­sen (Thymo-​Festucetum ci­ne­reae),
• Halb­tro­cken­ra­sen (Adonido-​Brachypodietum pin­na­ti) mit Fe­der­gras und
• Fels­ge­bü­schen mit Ge­mei­ner Zwerg­mis­pel.

Daran schlie­ßen sich Pechnelken-​Eichenwälder (Ge­nis­to tinctoriae-​Quercetum) an.

Pilze des Ge­bie­tes sind

• My­ce­na cro­ca­ta im Schlucht­wald,
• Ge­astrum fim­bria­tum und
• Ou­deman­si­el­la mu­ci­da im Hainwachtelweizen-​Buchenwald sowie
• In­o­no­tus drya­de­us und He­ri­ci­um erinaceus in den Ei­chen­tro­cken­wäl­dern und of­fe­nen Xe­ro­therm­kom­ple­xen.

Das Sel­ke­tal ist Le­bens­raum der Wild­kat­ze (Felis sil­vestris).
Im Na­tur­schutz­ge­biet kom­men sel­te­ne Fle­der­maus­ar­ten vor:

• Klei­ner Abend­seg­ler (Nycta­lus leis­le­ri),
• Bech­stein­fle­der­maus (Myo­tis bech­stei­ni),
• Klei­ne Huf­ei­sen­na­se (Rhi­no­lo­phus hip­po­si­de­ros)
• Brau­nes Lang­ohr (Ple­co­tus au­ri­tus)

Das Sel­ke­tal ist ein Ver­brei­tungs­schwer­punkt für die größ­te be­kann­te baum­brü­ten­de Mau­er­seg­ler­po­pu­la­ti­on Deutsch­lands.
Wei­ter­hin brü­ten im Ge­biet z. B.

• Mit­tel­specht (Den­dro­co­pos me­di­us)
• Was­ser­am­sel (Cin­clus cin­clus),
• Eis­vo­gel (Al­ce­do at­this) sowie ver­ein­zelt
• Zwerg­flie­gen­schnäp­per und Hals­band­schnäp­per (Fi­ce­du­la al­bi­col­lis).

Das Sel­ke­tal bie­tet auch ver­schie­de­nen Lurch­ar­ten ge­eig­ne­te Le­bens­be­din­gun­gen:

• Feu­er­sa­la­man­der (Sa­la­man­dra sa­la­man­dra),
• Berg- (Tri­tusus al­pestris) und
• Teich­molch (Tri­tu­rus vul­ga­ris),
• Ge­burts­hel­fer­krö­te (Aly­tes ob­ste­tri­cans),
• Erd­krö­te (Bufo bufo) und
• Gras­frosch (Rana tem­pora­ria).

Die Selke ist be­vor­zug­ter Le­bens­raum der Grop­pe (Cot­tus gobio).
Eine ty­pi­sche Li­bel­len­art der Selke ist die Zwei­ge­streif­te Quell­jung­fer (Cor­du­leg­as­ter bol­to­ni).